Zuerst wird das Serverprogramm installiert, die Macversion ist unter lab.tojio.com und die PC-Version unter wiiflash.org zu finden.
Wenn der heruntergeladene Server entpackt ist, wird die Wiimote mit dem Bluetooth synchronisiert. Das funktioniert auf den verschiedenen Systemen leicht unterschiedlich. Man startet zuerst den Bluetooth-Dialog und stellt dann die Verbindung mit der Wiimote her, die dann zum Beispiel als „NINTENDO-RVL-CNT-01“ angezeigt wird. Die Wiimote selbst beginnt die Synchronisation über das gleichtzeitigen Druck auf den „1“- und „2“-Button oder auf den Synchronisationsbutton im Batteriefach. Im Bluetooth-Dialog selbst muss man meist erst die Geräte durchsuchen und dann die gefundene Wiimote verbinden.
Der nächste Schritt ist es, den Server zu starten. Dieser erkennt die Wiimote automatisch, wenn sie korrekt verbunden ist und das Symbol für die angeschlossene Wiimote erscheint in der Serveranzeige (beim PC vibriert die Wiimote dann auch).